9.問:Cy3酰肼可以用于哪些應用領域?
答:Cyanine 3 酰肼(貨號146) 可以與含有醛基或酮基的分子反應,形成穩定的酰肼鍵。這種染料可以用于標記經過過氧化物酶氧化后的抗體和其他糖蛋白,或者標記受到氧化應激或脫氨作用的蛋白質,或者標記還原性的糖類。Cy3 NHS酯(貨號141)可以與含有氨基的分子反應,形成穩定的酰胺鍵。這種染料可以用于標記多肽、蛋白質和寡核苷酸中的氨基末端或伯胺。如果需要該類產品進行蛋白/抗體染色,請根據目標的反應基團和功能基團,按
需選擇。
10.問:Cy3NHS酯標記蛋白或抗體后,如何高效純化?
答:(1)(實驗常用)用凝膠過濾層析法:將標記反應液通過大小孔徑合適的凝膠過濾柱,用適當的緩沖液洗脫,收集流出液中的Cy3-蛋白標記物,并測定蛋白濃度和熒光強度。這種方法簡單快速,但可能會造成一些蛋白損失或稀釋。
(2)用逆相高效液相色譜法(RP-HPLC):將標記反應液通過逆相C18柱,用不同比例的水和有機溶劑(如乙腈或甲醇)作為流動相進行梯度洗脫,收集適當的色帶峰,冷凍干燥后得到Cy3-蛋白標記物。這種方法可以有效地分離和純化Cy3-蛋白標記物,但需要專業的儀器和操作技術。
(3)用親和層析法:如果待標記的蛋白具有特定的親和性,可以利用親和層析法進行純化。例如,如果待標記的蛋白是抗體,可以用蛋白A或蛋白G柱進行純化;如果待標記的蛋白是GST融合蛋白,可以用谷胱甘肽柱進行純化。這種方法可以保留蛋白的活性和穩定性,但需要特定的親和配體和緩沖液。
11.問:Cy3鏈霉親和素和Cy3NHS酯在蛋白的標記方面有何區別?
答:Cy3鏈霉親和素(貨號16912)是一種將Cy3熒光染料與鏈霉親和素(streptavidin)結合的偶聯物,可以用于檢測生物素化的生物分子,例如抗體、配體或DNA探針。
它可以用于間接標記法,即先用生物素化的**抗體或其他生物素化的探針與目標蛋白結合,然后用Cy3鏈霉親和素與生物素結合,產生熒光信號。
Cy3鏈霉親和素的操作方法取決于所使用的生物素化探針的類型和濃度,一般來說,需要先將樣品與生物素化探針孵育,然后用PBS或其他適當的緩沖液洗滌去除多余的探針,再加入適量的Cy3鏈霉親和素孵育,*后再次洗滌去除多余的偶聯物,就可以進行熒光檢測了。
12.問:Cy3疊氮化物和炔烴有什么關系?這兩個產品如何標記蛋白?
答:Cy3炔烴(貨號144)和疊氮化物(貨號143)可以在銅催化下發生[3+2]環加成反應,生成1,4-二取代的1,2,3-三唑衍生物,這種衍生物是Cy3染料的一種形式。
這種反應屬于點擊化學的范疇,因為它是高效、選擇性和正交的,即它不會受到其他官能團的干擾,也不會產生副產物。
Cy3炔烴和疊氮化物可以用來標記蛋白的方法是,將含有Cy3炔烴的蛋白和含有疊氮化物的標記分子(如抗體或其他配體)在銅催化下發生點擊化學反應,形成穩定的三唑連接,從而實現蛋白的熒光標記。
這種方法的優點是,它可以在溫和的條件下進行,不會破壞蛋白的結構和功能,而且反應選擇性高,不會受到其他官能團的干擾。 另外,Cy3染料是一種亮度高,熒光穩定,對pH不敏感的橘黃色熒光染料,它可以用532 nm激光線激發,并用TRITC濾光片組觀察。
13.問:Cy3 TCO是什么?它與Cy3 NHS相比有什么區別?
答:Cy3反式環辛烯 [Cy3 TCO](貨號900)是一種熒光染料,可以與四唑類化合物發生快速的點擊反應,形成穩定的共軛物。Cy3 TCO的優點是反應速度快,無毒,適用于多種生物體系。缺點是染料分子較大,可能影響標記分子的活性或穩定性。
Cy3反式環辛烯 [Cy3 TCO]和Cy3 NHS酯 [Cy3 NHS]是兩種不同的熒光染料,它們都可以用于標記含有氨基的生物分子,但是它們的反應機制和條件有所不同。Cy3 TCO是一種點擊化學試劑,它可以與四唑類化合物發生快速的無副產物的環加成反應。這種反應可以在水相或有機相中進行,不受pH、溫度、緩沖液等因素的影響。Cy3 NHS酯是一種活化酯試劑,它可以與氨基形成酰胺鍵3。這種反應需要在pH 7-9的緩沖液中進行,且受到水解、氨基競爭等因素的影響。因此,Cy3 TCO比Cy3 NHS酯具有更高的反應效率和選擇性,更適合標記活性或穩定性較低的生物分子。所以如果需要標記含氨基的生物分子,選擇不止Cy3NHS酯,Cy3 TCO也許是您實驗的更優良選擇,考慮自己的實驗條件,選擇*佳產品,可以事半功倍。
14問:Cy3四嗪是什么?它與其他常見的Cy3染料有何不同?
答:Cy3 tetrazine(貨號910)和其他Cy3染料的主要區別在于它們的反應基團和反應方式。Cy3 tetrazine是一種帶有四唑基團的熒光探針,它可以與TCO(反式-環辛烯)或其他應力烯烴發生特異性的點擊化學反應,形成穩定的生物結合物。這種反應具有快速、高效、無毒和無銅的優點。
15.問:PE-Cy5 Tandem和普通的Cy5染料相比,有什么優勢?
答:(1)PE-Cy5 Tandem(貨號2610)與FITC、PE在光譜上重疊范圍小,熒光干擾少,因此實驗中常將PE-Cy5 Tandem與FITC、PE搭配使用。普通的Cy5染料與單核細胞和粒細胞的非特異性結合多,實驗結果容易出現假陽性。
(2)PE-Cy5 Tandem具有較高的熒光強度和穩定性,可用于標記表達水平較低的蛋白。普通的Cy5染料的熒光強度和穩定性較低,適用于標記表達水平較高的蛋白。
(3)二者的染色步驟類似,主要根據蛋白的表達水平選擇適合自己實驗的產品。
16問:Cy5DIGE NHS酯是什么?它和Cy5NHS酯有什么區別?
答:Cy5DIGE NHS ester(貨號25306)是一種專門用于差異凝膠電泳(DIGE)分析的染料,它可以與C2DIGE和/或C3DIGE一起使用,來比較兩個或三個樣品中的蛋白質表達。Cy5DIGE NHS ester具有**的遷移匹配和高分辨率的蛋白質檢測能力。Cy5NHS則是一種更通用的染料,它可以用于標記核酸分子(DNA和RNA)以及其他生物分子。